一般原则

在大多数情况下，论文正文中的字体颜色要求为黑色。黑色是一种清晰、易读的颜色，并且在打印和电子设备显示中都能保证良好的视觉效果。例如，当你将论文打印出来时，黑色字体能够在白色纸张上形成鲜明对比，方便阅读；在电子设备上，黑色字体也能避免因颜色过浅或过艳而造成视觉疲劳或阅读困难。

特殊情况

强调部分：如果需要对正文中的某些关键内容进行强调，可以使用加粗、斜体或下划线等格式来突出，而不是改变字体颜色。不过，在一些允许的情况下，也可以使用一种与黑色有明显对比的深色，如深蓝或深灰色来突出特定内容。但这种情况比较少见，而且需要确保这种颜色变化不会影响整体的学术风格和可读性。例如，在一份设计类专业的论文中，可能会用深蓝字体来突出某一个设计理念的关键元素，但前提是论文整体风格允许这种装饰性的操作。

超链接颜色：如果正文中包含超链接，超链接的颜色通常会自动根据文档编辑软件的默认设置或学术期刊、机构的要求而改变。一般来说，超链接颜色是蓝色且带有下划线，以区别于普通文本。这是为了方便读者识别链接，引导他们获取更多相关的参考资料或补充信息。

学科特殊要求：在某些特定学科领域，可能会有特殊的字体颜色要求。例如，在化学领域，当展示化学结构、反应式等内容时，可能会使用彩色字体来区分不同的原子、化学键等元素。但这种情况通常是在专业的化学绘图软件或特定的格式要求下进行，并且会在论文中有明确的说明，以确保学术的规范性和可读性。

总之，论文正文中字体颜色通常为黑色，尽量避免使用过于花哨或会影响阅读的颜色变化，除非有特殊的强调、超链接或学科要求等情况。